Meyer, Julia Arielle
(2022).
« Processus d'assemblage des communautés microbiennes endolithiques et sessiles de la subsurface terrestre superficielle » Mémoire.
Montréal (Québec, Canada), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en biologie.
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Résumé
Les communautés microbiennes jouent un rôle important dans les écosystèmes de la subsurface terrestre. La plupart des études dans cet habitat se sont concentrées sur les communautés planctoniques et ne ciblent que des groupes microbiens spécifiques (bactéries, ou archées ou eucaryotes). Par conséquent, une compréhension des processus qui régissent l’ensemble des groupes microbiens appartenant aux communautés endolithiques et sessiles fait toujours défaut. Cette étude vise à comprendre (i) l'effet de la profondeur et (ii) des facteurs biotiques sur ces communautés ; (iii) de déterminer la proportion de ces communautés qui sont formées par les mouvements de flux verticaux et (iv) de comparer leur composition avec les communautés microbiennes détectées dans l’eau de l’aquifère. Pour ce faire, nous avons collecté des échantillons dans deux profils de sol (~ 0–50 m), effectué des extractions d'ADN et un séquençage Illumina. Les résultats suggèrent que les changements dans les caractéristiques du profil des sédiments de la subsurface terrestre avec la profondeur représentent un filtre écologique et phylogénétique efficace pour la plupart des communautés d'archées et de bactéries. De plus, les mouvements de flux verticaux depuis la surface jouent un rôle majeur dans les processus d'assemblage des communautés microbiennes sous la surface. En complément, nos résultats ont montré que la plupart des interactions biotiques entre les trois domaines étaient positives, ce qui peut indiquer des associations potentielles coopératives ou mutualistes telles que l'alimentation croisée ou les relations syntrophiques dans la subsurface terrestre superficielle. Nos résultats soulignent également l'importance d'échantillonner à la fois les phases liquide et solide d'un aquifère lorsqu'il s'agit d'étudier sa microbiologie globale.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : subsurface terrestre, microbes de la subsurface, génomique, bactéries, archées, eucaryotes, microorganismes sessiles, microorganismes endolithiques, interactions biotiques
| Type: |
Mémoire accepté
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| Informations complémentaires: |
Fichier numérique reçu et enrichi en format PDF/A. |
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Directeur de thèse: |
Lazar, Cassandre |
| Mots-clés ou Sujets: |
Écologie microbienne / Écologie souterraine / Interactions biotiques / Subsurface |
| Unité d'appartenance: |
Faculté des sciences > Département des sciences biologiques |
| Déposé par: |
Service des bibliothèques
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| Date de dépôt: |
09 mai 2022 12:54 |
| Dernière modification: |
09 mai 2022 12:57 |
| Adresse URL : |
http://archipel.uqam.ca/id/eprint/15457 |
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