Analyse en composantes principales d'héritabilité dans le cadre des études d'association génétique de grande dimension

Miftah, Hanane (2016). « Analyse en composantes principales d'héritabilité dans le cadre des études d'association génétique de grande dimension » Mémoire. Montréal (Québec, Canada), Université du Québec à Montréal, Maîtrise en mathématiques.

Fichier(s) associé(s) à ce document :
[img]
Prévisualisation
PDF
Télécharger (14MB)

Résumé

Dans ce mémoire, nous présentons une nouvelle approche de réduction de la dimension dans un contexte d'études d'association génétique avec présence de plusieurs variables réponses corrélées entre elles. Cette approche tente de résumer l'information utile de plusieurs variables (qualitatives ou quantitatives) corrélées dans un nombre réduit de nouvelles variables (scores) appelées composantes principales d'héritabilité. Ces nouveaux scores optimaux peuvent être utilisés dans des études d'association afin d'augmenter la puissance des tests statistiques appliqués pour détecter les gènes responsables des maladies complexes. Nous avons proposé une nouvelle statistique qui teste une telle association entre ces nouvelles composantes principales et une région génomique, et nous avons approximé sa distribution sous l'hypothèse nulle à l'aide des techniques de permutation. Nous avons également comparé notre nouvelle méthode avec une méthode existante (Klei et al., 2008). À l'aide de simulation, nous avons montré que notre nouvelle méthode contrôle bien l'inflation de l'erreur de type 1 et elle a un gain important de puissance statistique comparée à la méthode existante. Enfin, nous avons illustré notre méthodologie à l'aide d'une application sur des données réelles collectées pour étudier la maladie d'Alzheimer. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Études d'association génétique, variables réponses corrélées, réduction de la dimension, composantes principales d'héritabilité, puissance statistique.

Type: Mémoire accepté
Informations complémentaires: Le mémoire a été numérisé tel que transmis par l'auteur.
Directeur de thèse: Oualkacha, Karim
Mots-clés ou Sujets: Études d'associations génétiques / Réduction de dimension (Statistique) / Analyse en composantes principales / Héritabilité / Analyse de puissance (Statistique) / Maladie d'Alzheimer
Unité d'appartenance: Faculté des sciences > Département de mathématiques
Déposé par: Service des bibliothèques
Date de dépôt: 26 oct. 2016 19:59
Dernière modification: 20 janv. 2023 16:39
Adresse URL : http://archipel.uqam.ca/id/eprint/8969

Statistiques

Voir les statistiques sur cinq ans...